Seminarium Zakładu Biofizyki
sala nr 3091 (ICM, waście od strony Zakładu Biofizyki), al. Żwirki i Wigury 93
2009-06-05 (10:45) 
mgr Marta Narczyk (Zakład Biofizyki IFD UW)
Fosforylaza nukleozydów purynowych (PNP) z E. coli weryfikacja mechanizmu katalizy.
PNP katalizuje reakcję rozszczepienia wiązania glikozydowego w nukleozydach purynowych i niektórych analogach. Bakteryjne PNP jest homoheksamerem. Badania krystalograficzne sugerują, że można je traktować jako trimer dimerów. W podjednostkach tworzących dimer miejsca aktywne przyjmuj różną konformację. Badania wiązania ligandów, również sugerują istnienie dwóch miejsc aktywnych ze znacząco różnymi stałymi wiązania tak dla fosforanu jak i dla zasady purynowej. Na podstawie tych badań został zaproponowany mechanizm katalizy (Koellner G. et al., J. Mol. Biol. 315, 351, 2002). W celu przetestowania postawionej hipotezy przygotowane zostay mutanty miejsca aktywnego. Na seminarium zostaną przedstawione wyniki badań kinetycznych, kalorymetryczny i fluorescencyjnych biaka dzikiego i mutantów.