Seminarium Zakładu Biofizyki
sala nr 3091 ICM, waście od strony Zakładu Biofizyki, al. Żwirki i Wigury 93
Maciej Dziubiński (IFD UW)
Modele gruboziarniste - uproszczenie na wyrost?
Zaprezentowane zostaną modele białek (CABS i UNRES), jak również białek i kwasów nukleinowych (RedMD), w których podstawowym uproszczeniem jest zastosowanie "ziaren" (united atoms), zastępujących grupy atomów (np. łańcuchy boczne aminokwasów). Omówione zostaną podstawowe cechy modeli oraz ich zastosowania. Podjęta zostanie też próba uzasadnienia stosowania modeli gruboziarnistych w kontekście kinetyki zwijania białek.