Seminarium Zakładu Biofizyki
sala nr 3091 ICM, waście od strony Zakładu Biofizyki, al. Żwirki i Wigury 93
2010-03-30 (15:00) 
dr Maciej Długosz (ICM UW)
Struktura drugorzędowa natywnych i patogennych N-terminalnych fragmentów huntingtyny. Symulacje replica exchange molecular dynamics
Genetyczna choroba Huntingtona atakuje ośrodkowy układ nerwowy. Jej przyczyną jest mutacja w genie HD, kodującym białko huntingtynę (Htt). Mutacja polega na ekspansji trójki kodonu CAG oznaczającego glutaminę. W sekwencji zmutowanej huntigtyny pojawia się długi (> 35) ciąg glutamin. Nieprawidłowe białko agreguje w komórkach nerwowych, powodując ich apoptozę. Mechanizm patogenezy choroby Huntingtona nie jest dokładnie poznany. Zazwyczaj jednak wiąże się jej powstawanie ze zmianą konformacji zachodzącą w obrębie wydłużonych traktów polyQ, prowadzącą do anormalnych oddziaływań i agregacji. Przedstawione zostaną wyniki zwijania ab initio dwóch wariantów N-terminalnych fragmentów białka Htt: natywnego (zawierającego trakt polyQ o długości 17) i zmutowanego (zawierającego trakt polyQ o długości 55), metodą pełnoatomowej dynamiki molekularnej. Wyniki symulacji zostana omówione w świetle proponowanych dotychczas mechanizmów patogenezy choroby Huntingtona.