Seminarium Zakładu Biofizyki
sala nr 3091 ICM, waście od strony Zakładu Biofizyki, al. Żwirki i Wigury 93
2011-01-07 (14:30) 
mgr Julia Romanowska (IFD UW)
Analiza porównawcza miejsc wiążących antybiotyki aminoglikozydowe na enzymach
Enzymatyczna modyfikacja antybiotyków aminoglikozydowych jest najpowszechniejszym sposobem oporności bakterii na te leki. Enzymów takich jest wiele i są różnorodne. Podzielono je na trzy duże rodziny, odmienne pod wzgledem ksztaltu, sekwencji czy domniemanej pierwotnej funkcji biologicznej. Jednak aminoglikozydy to chemicznie jednolita grupa antybiotykow. Powstaje pytanie jak tak różne białka mogą rozpoznawać specyficznie tak podobne do siebie małe czasteczki? Na seminarium będzie przedstawiona próba odpowiedzi na to pytanie przy zastosowaniu różnych narzędzi teoretycznej biofizyki, m.in. symulacji dynamiki molekularnej, obliczeń elektrostatyczych oraz analizy sieci wiązań chemicznych. Przedstawie wstępne wyniki zostały uzyskane podczas stażu naukowego w grupie badawczej dr Nathalie Reuter na Uniwersytecie w Bergen, w Norwegii.