Seminarium Zakładu Biofizyki

Neuroglobina jest stosunkowo nowym członkiem rodziny globin (została odkryta w 2000 roku), występującym w komórkach nerwowych, o nie poznanej do tej pory funkcji. W ludzkiej neuroglobinie może występować jeden mostek dwusiarczkowy, którego obecność wpływa na powinowactwo białka do cząsteczek tlenu lub innych dwuatomowych cząsteczek, i na kinetykę ich asocjacji. Istnienie takiej formy białka jest prawdopodobne w komórkach w czasie stresu oksydacyjnego i może być kluczem do zrozumienia ich działania. Na seminarium będą opisane eksperymenty fotolizy błyskowej wykonane przez prelegentkę w czasie stażu na Uniwersytecie w Parmie, oraz zostaną przedstawione przebiegi kinetyki reasocjacji cząsteczki tlenku węgla do neuroglobiny (głównie w obecności mostka dwusiarczkowego) w różnych temperaturach, różnych pH, i różnych stężeniach CO. Będą omówione metody analizy sygnałów uzyskanych w eksperymentach fotolizy błyskowej oraz próby zastosowania dwóch modeli kinetycznych do uzyskanych wyników. Różnice w ruchach białek, które można zaobserwować w trakcie symulacji dynamiki molekularnych w różnych warunkach mogą być ważną wskazówką dla zrozumienia różnic w uzyskanych sygnałach oraz w szukaniu właściwego modelu kinetycznego asocjacji. Dlatego dodatkowo zostaną zaprezentowane metody prowadzonych obecnie symulacji komputerowych, których wyniki mogą być bardzo pomocne w analizie uzyskanych pomiarów.