Seminarium Zakładu Biofizyki

Kompleks enzymatyczny Dcp1/2 jest jednym z głównych białek odpowiedzialnych za usuwanie struktury 5' mRNA kapu. Z tego powodu białko to odgrywa znaczącą rolę w metabolizmie mRNA. Na seminarium zostaną przedstawione wyniki badań nad oddziaływaniami syntetycznych analogów kapu z wyżej wymienionym kompleksem białkowym. Pomimo, że związki te nie są substratami dla katalitycznej podjednostki kompleksu Dcp2 to szereg wcześniejszych doniesień literaturowych wskazywał, że mogę one mieć wpływ na aktywność enzymatyczną. Pomiary aktywności katalitycznej Dcp1/2 w obecności analogów kapu wykazały, że niektóre z nich (modyfikowane grupą tiofosforanową lub boranofosforanową) wykazują zdolność do inhibicji tego enzymu. Dodatkowo, związek o największym potencjale inhibitorowym, m7GpSpppSm7G D3 został użyty do badań nad kinetyką reakcji dekapingu przez Dcp1/2. Aktualne wyniki wskazują na nietypowy mechanizm inhibicji tego procesu.

Dcp1/2 enzymatic complex is one of the major proteins responsible for 5' mRNA cap cleavage. Hence, this protein plays a vital role in mRNA metabolism. In the seminary the current results of studies on interactions between synthetic cap analogues and the above-mentioned protein complex will be presented. Despite the fact that these compounds are not recognized by catalytically active subunit Dcp2, a number of previous observations indicate that its enzymatic activity may be dependent upon interactions with cap analogues. It has been found that some of modified cap analogues, namely the compounds bearing either tiophosphate or boranophosphate moieties are capable of inhibiting Dcp2 catalytic activity. Furthermore, the compound displaying the most significant inhibitory potential, m7GpSpppSm7G D3 has been applied to kinetic studies on decaping reaction mediated by Dcp1/2. The obtained results suggest an unusual mechanism of inhibition.