Seminarium Zakładu Biofizyki
sala nr 3136 im. Prof. Jana Samsonowicza, al. Żwirki i Wigury 93
mgr Zofia Gasik (IFD UW)
Duplikacja chromosomu w drożdżach w warunkach szoku cieplnego
Chromosomal duplication in yeasts under heat stress
W pierwszym momencie w warunkach stresu cieplnego w komórkach drożdży dochodzi do zduplikowania całego chromosomu III oraz dwóch fragmentów chromosomów IV i XII. W czasie seminarium przedstawione będą próby wytłumaczenia tego zjawiska poprzez zastosowanie metod bioinformatycznych, w szczególności poprzez analizę białek pozbawionych struktury trzeciorzędowej (IDP-Intrinsically Disorder Proteins). Dodatkowo zostanie przedstawiona także analiza funkcji białek oraz ich oddziaływań kodowanych na duplikowanych fragmentach.Badania zostały przeprowadzone w czasie stażu w laboratorium prof. Burkharda Rosta na Wydziale Informatyki Technicznego Uniwersytetu w Monachium.
Under heat stress in yeast cells the aneuploidy occurs: the chromosome III is duplicated along with two fragments from chromosomes IV and XII. During the talk the attempts to explain this phenomenon using bioinformatics method will be presented, especially Intrinsically Disordered Proteins (IDP) analysis. Additionally, analysis of function and interaction of the proteins encoded on duplicated fragments will be shown.All results were obtained during a research visit in RostLab, Faculty of Informatics at Technical University Munich.