Seminarium Zakładu Biofizyki

Struktura trimetyloguanozyno (TMG) kapu występuje na 5’ końcu małych jądrowych RNA (snRNA). Pełni ona niezwykle istotną rolę w transporcie jądrowym oraz w splicingu pre-mRNA. TMG kap jest tzw. sygnałem lokalizacji jądrowej NLS (ang. Nuclear Localization Signal), warunkującym import snRNP (małych jądrowych rybonukleoprotein) do jądra komórkowego. Jest to możliwe dzięki specyficznemu oddziaływaniu z białkiem adaptorowym, snurportyną 1. Na seminarium zaprezentowane zostaną wyniki badań oddziaływania snurportyny z analogami trimetyloguanozyno kapu, posiadającymi modyfikacje w łańcuchu 5’,5’-trifosforanowym, przeprowadzonych przy użyciu metody miareczkowania fluorescencyjnego.Modyfikacje struktury TMG kapu mają na celu zwiększenie odporności na degradację enzymatyczną, a w konsekwencji wydłużenie czasu życia in vivo, oraz zwiększenie powinowactwa do snurportyny 1, co przekłada się na zwiększenie trwałości oraz efektywności sygnału transportu dojądrowego. Wyżej wymienione właściwości mogą okazać się niezwykle istotne w terapii z wykorzystaniem oligonukleotydów działających w jądrze komórkowym (np. zapobiegających błędnej transkrypcji, splicingu pre-mRNA).

Trimethylguanosine (TMG) cap structure (m32,2,7GpppG) was found at 5’ end of mRNA’s trans-splicing organism including flatworms, nematodes and chordates. Hypermetylated cap structure is also present at 5’ ends of some small nuclear RNAs (snRNAs) and is important factor for nucleomembrane transport and splicing of pre-mRNA. Important feature of TMG capped snRNAs in higher organisms including humans is the possibility of their transport from the cytoplasm to the nucleus. The formation of the TMG-snurportin complex is critical for efficient nuclear import. It has recently been shown that it might be potentially useful for therapeutic purposes.During the seminar I will present the results of binding studies between snurportin 1 and TMG cap analogs modified in 5’,5’-triphosphate bridge. These studies were performed using a titration assay based on quenching of the intrinsic protein fluorescence by cap analogs. The aim of modifications was to obtain TMG cap analogs resistance against deccaping enzymes and increased stability in vivo, which could be useful for studying TMG related cellular processes and potential medicinal applications.