Seminarium Zakładu Biofizyki
sala 17, ul. Pasteura 7
dr Joanna Kowalska (IFD UW)
Nowe nukleotydowe sondy do badań NMR i badań fluorescencyjnych
Novel nucleotide probes for NMR and fluorescence studies
Nukleotydowe i oligonukleotydowe sondy molekularne umożliwiają badanie aktywności enzymów metabolizujących nukleotydy, poszukiwanie inhibitorów tych enzymów metodami przesiewowymi, jak również wykorzystywane są szeroko w badaniach strukturalnych i technikach bioanalitycznych. Na seminarium będą przedstawiome ostatnie wyniki prac nad nukleotydowymi sondami przeznaczonymi do badań NMR i fluorescencyjnych. W szczególności będą omówione właściwości i zastosowania fluorofosforanowych analogów nukleotydów, które dzięki obecności atomu fluoru mogą zostać wykorzystane w badaniach 19F NMR oraz nukleotydów znakowanych pirenem, które dzięki nietypowym właściwościom fluorescencyjnym, mogą znaleźć ciekawe zastosowania bioanalityczne.
Nucleotide and oligonucleotide molecular probes are useful for studying nucleotide-metabolizing enzymes and high throughput screening for their inhibitors as well as find versatile applications in structural studies and bioanalitics. In the seminar, I would like to present the newest research of our group directed at developing nucleotide probes for NMR and fluorescent studies. In particular, I would like to focus on the properties and applications of fluorophosphate nucleotide analogs, which due to the presence of a fluorine atom have utility in 19F NMR studies, and on pyrene-labeled nucleotides, which due to their unique fluorescent properties, have potentially interesting bioanalytical applications.