Seminarium Zakładu Biofizyki
sala 17, ul. Pasteura 7
mgr Marcin Sobieraj (IFD UW)
Wektorowy autoregresyjny model analizy przyczynowości dla układów (bio)molekularnych
Vector autoregressive model of causality analysis for (bio)molecular systems
Rozpoznanie relacji przyczynowych pomiędzy zdarzeniami obserwowanymi w symulacjach dynamiki molekularnej układów (bio)molekularnych ma kluczowe znaczenie w ich opisie i zrozumieniu sposobu funkcjonowania. Podczas seminarium przedstawiony zostanie matematyczny model pozwalający badać relacje przyczynowo-skutkowe pomiędzy wielokanałowymi sygnałami wektorowymi. Model ten bazuje na metodach analizy opracowanych początkowo na potrzeby ekonomii. Za prace nad tymi metodami dwóch ekonomistów: Clive Granger i Robert Englem otrzymało w roku 2003 nagrodę Nobla z dziedziny ekonomii. W odróżnieniu od oryginalnych metod badających przyczynowość pomiędzy sygnałami skalarnymi metoda przedstawiona na seminarium pozwala badać przyczynowość pomiędzy sygnałami wektorowymi.
Detection of causal relations between events observed in molecular dynamic simulations is of key importance for the understanding of behaviour and functioning of complex (bio)molecular systems. During the seminar will be presented a mathematical model to examine the causal relation between multichannel signals vector. This model is based on analysis methods developed initially for the needs of the economy. For his work on these methods two economists Clive Granger and Robert Engel received in 2003 the Nobel Prize in economics. In contrast to the original methods of examining the causality between scalar signals method presented in the seminar can examine causality between vector signals.