Seminarium Zakładu Biofizyki
IGF, sala 109, ul. Pasteura 7
2014-04-25 (14:00) 
Kaja Fac (IFD UW)
Wykorzystanie reakcji S-alkilowania do syntezy nowej klasy analogów końca 5’ mRNA zawierających ugrupowanie 5’-S-tioestrowe
The use of S-alkylation reaction for the synthesis of a new class of analogues of the 5 'end of the mRNA containing 5'-S-thioester moiety
Przedstawiona zostanie nowa klasa dinukleotydowych analogów końca 5’ mRNA, posiadających wiązanie 5’-S-tioestrowe, otrzymane w reakcji S-alkilowania. Wykonanie syntezy takich związków było pierwszym krokiem do opracowania wydajnej, posttranskrypcyjnej metody chemicznej ligacji kapu do mRNA, co w przyszłości pozwoliłoby uzyskać zakończone kapem mRNA bez użycia metod enzymatycznych. Nowe analogi kapu poddano badaniom spektroskopii 31P i 1H NMR oraz wysokorozdzielczej spektrometrii mas (HRMS). Wstępne badania biofizyczne z białkami eIF4E oraz z DcpS wskazują na ciekawe właściwości tej klasy związków.
A new class of dinucleotide analogues of the 5 'end of mRNA having a 5'-S-thioester bond, obtained by S-alkylation reaction, will be presented. Synthesis of these compounds was the first step to develop productive, post-transcriptional chemical ligation method of cap to the mRNA, which in the future would get completed mRNA transcripts without the use of enzymatic methods. All synthesized compounds were characterized by 1H and 31P NMR and MS/MS. The preliminary results of biophysical studies of eIF4E protein and DcpS enzyme indicate the interesting properties of this class of compounds.