Seminarium Zakładu Biofizyki

Rozpoznanie relacji przyczynowych pomiędzy zdarzeniami obserwowanymi w dynamikach (bio)molekularnych ma kluczowe znaczenie dla ich opisu oraz zrozumieniu sposobu funkcjonowania. Podczas seminarium przedstawiony zostanie matematyczny model pozwalający badać relacje przyczynowo-skutkowe pomiędzy wielokanałowymi sygnałami wektorowymi. Model ten bazuje na metodach analizy opracowanych początkowo na potrzeby ekonomii. Za prace nad tymi metodami dwóch ekonomistów: Clive Granger i Robert Englem otrzymało w roku 2003 nagrodę Nobla z ekonomii. W odróżnieniu od oryginalnych metod badających przyczynowość pomiędzy sygnałami skalarnymi, metoda zaprezentowana na seminarium pozwala badać przyczynowość pomiędzy sygnałami wektorowymi. Ponadto, przedstawiona zostanie analiza przyczynowości dla modelowych układów molekularnych wykonana w oparciu o rozwijany model.

Detection of causal relations between events observed in molecular dynamic simulations is of key importance for the understanding of behaviour and functioning of complex (bio)molecular systems. During the seminar a mathematical model will be presented to examine the causal relations between multi-channel signals vector. This model is based on analytical methodology developed initially for economy by Clive Granger and Robert Engel, who received Nobel Prize in economy in 2003. In contrast to previous methods of examining the causality between scalar signals, the method presented at the seminar deals with causality between vector signals. Additionally, the analysis of causality will be presented for molecular systems based on the developed model.