Seminarium Zakładu Biofizyki
IGF, sala 109, ul. Pasteura 7
dr Anna Niedźwiecka (Środowiskowe Laboratorium Fizyki Biologicznej IF PAN oraz Zakład Biofizyki IFD WF UW)
Co chcielibyście wiedzieć o biofizyce oddziaływań białek z ligandami, a boicie się zapytać - na przykładzie białek wiążących kap 5’ mRNA
What you would like to know about protein-ligand interactions but are afraid to ask - case studies of the mRNA 5’ cap binding proteins
Dlaczego stałe asocjacji to za mało? Naturalnym językiem biofizycznej analizy oddziaływań i procesów biomolekularnych jest język parametrów termodynamicznych. Podczas seminarium przypomnę o zjawiskach termodynamicznie sprzężonych z oddziaływaniami białko-ligand, metodach ich identyfikacji, pułapkach eksperymentalnych i ich konsekwencjach dla poprawnej analizy wyników.
Why is the concept of an association constant insufficient? The natural language needed for the description biomolecular interaction and processes is based on the thermodynamic parameters. During this seminar, I will remind the phenomenon of thermodynamic coupling of protein-ligand interactions with other accompanying processes. Methods of their identification, experimental pitfalls and their consequences for proper data analysis will be also discussed.