Seminarium Zakładu Biofizyki
IGF, sala 109, ul. Pasteura 7
Dominika Strzelecka (IFD UW)
Zastosowanie DMSO (dimetylosulfotlenku) jako dodatku do fazy mobilnej w badaniu ilościowym białek metodą LC-MS
Application of dimethyl sulfoxide (DMSO) as a mobile phase additive in quantitative proteomics using LC-MS method
Badania jakościowe i ilościowe białek są kluczowe w poznawaniu procesów komórkowych, szlaków sygnałowych, reakcji komórki na niestandardowe warunki zewnętrzne czy poszukiwaniu markerów chorób. Ze względu na swoją czułość i dokładność, techniką, która dominuje podczas analiz proteomicznych jest LC-MS. Istnieje wiele metod analizy ilościowej, a jedną z nich jest tak zwana metoda "top 3 approach (Top3)", którą zostanie przedstawiona na seminarium. Omówione będą korzyści jakie płyną z zastosowania DMSO jako dodatku do fazy ruchomej zarówno podczas badań jakościowych jak i ilościowych.
Qualitative and quantitative proteins analysis is crucial in investigating cell processes, signal pathways, cell response under untypical conditions and research of biomarkers. Mass spectrometry is a technique, which is dominant in proteomic analysis owing to high sensitivity and accuracy. There are many quantitative methods. One of them is "top 3 approach (Top3)", which will be presented on the seminar. Furthermore, it will shown why addition of DMSO to mobile phase is beneficial both in qualitative and quantitative methods.