Seminarium Zakładu Biofizyki

Sondy molekularne to cząsteczki, które imitując substrat enzymu, ulegają reakcji enzymatycznej i wykazują efekt, który może być mierzalny makroskopowo, co pozwala na śledzenie procesów biochemicznych. W trakcie seminarium zostaną omówione przykłady sond opartych na strukturze nukleotydów (sondy wykazujące efekt FRET, efekt ekscymerowy), a następnie przykłady użycia takich związków w eksperymentach biologicznych. Będą omówione eksperymenty w których przy pomocy analogu ATP, wykazującego efekt FRET, zbadano aktywność białka NudT2 - ludzkiego białka, które uważa się za czynnik prognostyczny w nowotworach piersi. Zostanie także zaprezentowany przykład użycia analogu Ap3A w badaniu aktywności białka Fhit - ludzkiego białka supresorowego, którego działanie często jest zaburzone w różnego rodzaju nowotworach.

Molecular probes are compounds exhibiting an effect that can be measured macroscopically while undergoing chemical reactions or binding to another molecule (e.g. protein). During the seminar, it will be presented examples of nucleotide probes (exhibiting FRET effect, excimer effect) and biological experiments will be discussed, in which such probes were used. The speaker will present an experiment, in which an ATP analogue exhibiting FRET effect was used to study the activity of NudT2, a human protein that has been shown to be prognostic factor for breast cancer. He will also present the use of Ap3A analogue for studying activity of human Fhit enzyme, a tumor suppressor which activity is frequently affected in different cancer types.