Seminarium Zakładu Biofizyki
IGF, sala 109, ul. Pasteura 7
2016-03-04 (14:15) 
Sylwia Bednarek (IFD UW)
Charakteryzacja analogów kapu i transkryptów mRNA modyfikowanych w mostku trifosforanowym i zawierających biotynę w rybozie 7-metyloguanozyny
Investigation of biochemical properties of a series of cap analogues and mRNA transcripts bearing modifications in the triphosphate bridge and labelled with biotin at the ribose of 7-methylguanosine
Charakterystyczna struktura końca 5’ eukariotycznego mRNA (kap) pełni szereg istotnych funkcji w procesach ekspresji informacji genetycznej, m. in. inicjacji translacji, dojrzewaniu RNA, transporcie wewnątrzkomórkowym czy degradacji RNA. W celu badania tych procesów zaprojektowano oraz otrzymano szereg dinukleotydowych analogów struktury kapu zawierających znacznik powinowactwa (biotynę) na rybozie 7-metyloguanozyny oraz modyfikowanych w mostku trifosforanowym bioizosterami tlenu w sposób obniżający ich podatność na degradację enzymatyczną. W ramach seminarium przedstawione zostaną właściwości biochemiczne tych związków, oraz eksperymenty mające na celu weryfikację ich przydatności jako reagentów do modyfikacji końca 5’ mRNA.
Characteristic of eukaryotic cellular mRNA is the presence of the 5’-terminal cap structure, which facilitates interactions between mRNA and a number of biomolecules taking part in its processing. A set of cap-derived, site-specifically biotinylated molecular tools were synthesized; designed to retain natural activity, confer enhanced stability and possess a wide applicability in a range of methods for further investigations of gene expression. The seminar will focus on a variety of experiments conducted in order to establish binding affinities to eIF4E, in vitro co-transcriptional capping efficiencies, translational efficiencies, and other vital properties of those compounds.