Seminarium Zakładu Biofizyki

Eukariotyczne mRNA posiadają na 3’końcu cząsteczki dodawany post-transkrypcyjnie tzw. ogon poliadeninowy (sekwencję kilkudziesięciu do kilkuset nukleotydów adeninowych). Skracanie ogona poli-A zapoczątkowuje enzymatyczną degradację mRNA. Stabilizacja ogona poli-A (np. poprzez wykorzystanie modyfikowanych analogów ATP) ma na celu otrzymanie mRNA o zwiększonej odporności, i w konsekwencji wydłużonym czasie trwania w komórkach. W przedstawionej prezentacji omówiona zostanie metoda analizy długości ogona poli-A oparta na specyficznym dobudowywaniu sekwencji poli-G do badanych transkryptów i RT-PCR oraz jej wykorzystanie do badania poliadeninowanych in vitro transkryptów mRNA lucyferazy.

Eucaryotic mRNAs posses post-transcriptionally added polyadenine tail on the 3' end of the particle (a sequence in range from tens to hundreds of adenine nucleotides). The shortening of the poly-A tail initiates the enzymatic degradation of mRNA. The stabilization of the poly-A tail (e.g. with modified analogs of ATP) aims at obtaining mRNA with increased resistance and, in consequence, with a prolonged life-time within the cells. In the presented work, the method of analysis of the poly-A tail length based on the addition of the specific poly-G sequence to tested transcripts and RT-PCR will be described, and its use in studies of polyadenylated in vitro luciferase mRNA transcripts will be discussed.