Seminarium Zakładu Biofizyki
sala 1.03, ul. Pasteura 5
2016-11-04 (14:15) 
mgr Michał Tyras (CeNT UW)
Metody znakowania białek in vivo w identyfikacji oddziaływań białko-białko
In vivo protein labeling for identification of protein-protein interactions
Oddziaływania międzybiałkowe są niezbędne do wszystkich procesów komórkowych. Niemniej identyfikacja i mapowanie takich oddziaływań u partnerów molekularnych jest rzeczą nietrywialną w warunkach fizjologicznych. W ramach prezentacji przedstawione będą metody służące do identyfikacji nawet słabych oddziaływań poprzez znakowanie in vivo. Omówiona zostanie przede wszystkim metoda BioID wykorzystującą ligazę biotyny w kontekście mapowania interaktomubiałek dekapujących.
Protein-protein interactions are involved in all cellular processes. However, identification and mapping of such interactions is complicated for physiologically relevant conditions. In this presentation novel methods for proximity-based protein labeling allowing identification of even weak and transient interactions will be discussed. The focus will be on biotin ligase dependent BioID method and how we can use it to explore decapping enzymes interactome.