Seminarium Zakładu Biofizyki

Enzym Nudt12, należący do rodziny białek NUDIX, obok opisanej ostatnio aktywności usuwania kapu z końca 5’ mRNA in vitro, posiada również zdolność hydrolizy dinukleotydowych analogów struktury kapu końca 5’ mRNA. Prezentowane wyniki dotyczą analizy specyficzności substratowej ssaczych białek Nudt12 (ludzkiego i mysiego) oraz badania kinetyki reakcji hydrolizy dla wybranych substratów. Badano dinukleotydowe analogi kapu różniące się stopniem metylacji guanozyny, rodzajem drugiego, niemetylowanego nukleotydu oraz długością mostka fosforanowego. Uzyskane wyniki pokazały, że ssaczy Nudt12 jest zdolny do hydrolizy szerokiej gamy dinukleotydów. Dla wybranych analogów wyznaczono podstawowe parametry kinetyczne wykorzystując model kinetyki Michaelisa-Menten.

Nudt12 enzyme, which belongs to the NUDIX protein family, next to the recently described decapping activity of 5' end mRNA in vitro, is also able to hydrolyse dinucleotide cap analogues. Here we present the results of analysis of mammalian (human and murine) Nudt12 enzyme’s substrate specificity and kinetics studies for selected substrates. Dinucleotide analogues of cap structure, which differ in the second nucleobase, number of methyl groups in guanosine and length of the phosphate bridge, were subjects of conducted studies. Obtained results showed that mammalian Nudt12 enzyme is able to hydrolyse a wide range of dinucleotide substrates. For selected analogues, using the Michaelis-Menten model of enzyme kinetics, basic kinetic parameters were determined.