Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
mgr Łukasz Charzewski (IFD UW)
Modelowanie molekularne struktury homotrimerycznej MMP-9
Molecular modeling of MMP-9 trimeric structure
MMP-9, wielodomenowe białko należące do rodziny metaloproteinaz macierzy zewnątrzkomórkowej, charakteryzuje się ogromną ruchliwością i elastycznością struktury. Funkcjonalne MMP-9 występuje przede wszystkim w postaci monomerów lub nieinhibicyjnych kompleksów z inhibitorem - TIMP-1, jednak najnowsze badania strukturalne identyfikują także nieaktywowane MMP-9 w postaci homotrimerów uformowanych w kształt okręgu, stabilizowanych przez wiązania dwusiarczkowe. W czasie seminarium zostaną przedstawione wyniki modelowania struktury takich układów.
MMP-9 is a multidomain protein which belongs to the matrix metalloproteinases family, expressing enormous structure mobility and flexibility. Functional MMP-9 exists mostly as a monomer or a noninhibitory complex with its TIMP-1 inhibitor, however, recent studies reveal also nonactivated MMP-9, in a form of circular-shaped homotrimers stabilized with disulphide bonds. During seminar results of molecular modelling of these structures will be presented.