Seminarium Zakładu Biofizyki

Do zgłębienia procesów związanych ze strukturą i funkcją kwasów nukleinowych (DNA i RNA) często wykorzystywane są sondy fluorescencyjne, których właściwości zmieniają się selektywnie pod wpływem badanego procesu. Do takich sond fluorescencyjnych można zaliczyć nukleotydy z modyfikowanymi zasadami azotowymi, które zachowując swoją funkcjonalność wykazują silniejsze właściwości fluorescencyjne. Aby otrzymać optymalną sondę najczęściej zasadę azotową modyfikuje się pozycji 8, co jest osiągalne dzięki nowoczesnym metodom chemii metaloorganicznej ("cross-coupling") oraz nie zaburza parowania zasad. Na seminarium zostaną zaprezentowane właściwości fluorescencyjne nowych analogów mRNA 5' kapu modyfikowanych w pozycji C8 guaniny lub 7-metyloguaniny oraz ich potencjalna użyteczność w badaniu procesów komórkowych zależnych od kapu.

To investigate processes related to the structure and function of nucleic acids (DNA and RNA), fluorescent probes are often used because they are able to change their properties selectively under influence of the process under study. Such fluorescent probes include nucleobase-modified nucleotides, which retain their functionality but exhibit stronger fluorescence emission. To obtain optimal probes, C8 position of nucleobase is most commonly modified, which can be achieved by modern organometallic chemistry (cross-coupling) and does not perturb base pairing. During the seminar the fluorescent properties of new mRNA 5' cap analogues modified at the C8 position of guanine or 7-methylguanine will be presented as well as their potential applications in the study of cap-related processes.