Seminarium Zakładu Biofizyki

Fluorescencyjne sondy nukleotydowe to związki, które zmieniają swoje właściwości pod wpływem wiązania przez białko lub w czasie reakcji enzymatycznej. Obserwując zmianę widma emisji takiego związku można np. śledzić przebieg reakcji enzymatycznych katalizowanych przez pirofosfatazy. Nieprawidłowości w działaniu pirofosfataz mogą prowadzić do rozwoju różnego rodzaju chorób, zatem opracowanie skutecznej metody monitorowania aktywności tych enzymów może być przydatne w poszukiwaniu cząsteczek regulatorowych o potencjale terapeutycznym. Tematem seminarium będą sondy nukleotydowe wykazujące efekt FRET. Zostanie przedstawiona ich synteza, właściwości spektroskopowe oraz przykładowe zastosowania w monitorowaniu reakcji hydrolizy enzymatycznej przebiegających in vitro i w komórkach.

Fluorescent nucleotide probes are compounds that change properties upon protein binding or enzymatic transformation. For instance, by observing changes in fluorescence emission, one can monitor progress of enzymatic reactions catalyzed by pyrophosphatases. Deregulation of pyrophosphatase activity has been linked to disease development. Therefore, efficient methods for monitoring activity of these enzymes would be useful in searching for regulatory molecules of therapeutic potential. The topic of the seminar is: nucleotide probes exhibiting FRET effect, their synthesis, spectroscopic properties, and examples of application in enzymatic hydrolysis monitoring in vitro and in the living cell.