Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
2018-04-20 (14:30) 
Olga Perzanowska (IFD UW)
Synteza i właściwości koniugatów nanocząstek złota z analogami końca 5' mRNA - sond molekularnych do badań metabolizmu mRNA
Synthesis and properties of gold nanoparticle conjugates with mRNA 5'-end analogs - molecular probes for study of mRNA metabolism
Celem naszej pracy jest synteza sondy molekularnej pozwalającej na badanie procesu degradacji enzymatycznej struktury końca 5' mRNA przez białko DcpS. W tym celu przeprowadziliśmy syntezę podwójnie sfunkcjonalizowanego dinukleotydowego analogu kapu. Cząsteczka kapu została wyznakowana barwnikiem fluorescencyjnym i sprzęgnięta z cząsteczką kwasu liponowego umożliwiającego adsorpcję cząsteczek kapu do powierzchni nanocząsek złota. Nanocząstki z złota (AunPs) posiadają zdolność do wygaszania fluorescencji pobliskich fluoroforów. W naszych badaniach postanowiliśmy wykorzystać to zjawisko do stworzenia testu enzymatycznego do badania aktywności białka DcpS, poprzez obserwację zmian intensywności fluorescencji w układzie analog kapu - nanocząstka złota.
The goal of our project was to create a molecular probe for study of cap analogues' enzymatic degradation by DcpS enzyme. We synthesized a bifunctionalized dinucleotide cap analogue. Cap analogue was tagged with fluorescent dye and conjugated with lipoic acid, which enabled attaching cap moieties to the surface of gold nanoparticles. Gold nanoparticles (AuNPs) have a unique ability to quench fluorescence of nearby fluorophores. In our project we made use of this phenomenon to create an enzyme assay for DcpS protein, by observing changes in fluorescence intensity caused by DcpS enzymatic activity in cap analogue-gold nanoparticle system.