Seminarium Zakładu Biofizyki

Gen białka IFIT1 ulega ekspresji w wyniku np rozpoznania obcego mRNA w komórce gospodarza przez odpowiednie sensory RNA. Zrozumienie mechanizmu leżącego u podstaw badanej interakcji oraz elementów strukturalnych mRNA odpowiedzialnych za prawidłowe rozpoznanie transkryptu jako własny ma istotne znaczenie dla dalszego rozwoju terapii opartych o cząsteczki mRNA. W wyniku reakcji transkrypcji in vitro otrzymano różnie kapowane, natywnie występujące krótkie transkrypty.Wykorzystując spektroskopię fluorescencyjną oraz interferometrię biowarstwową wykonano badania kinetyczne z kompleksami IFIT1 i IFIT5 z różnie kapowanymi mRNA.

The IFITl protein gene is expressed as a result of, e.g., recognition of a foreign mRNA in a host cell by suitable RNA sensors. Understanding the mechanism underlying the studied interaction and mRNA structural elements responsible for correct diagnosis transcript as its own is essential for the further development of therapy based on mRNA molecules. As a result of in vitro transcription reactions different native short transcripts were given.Using fluorescence spectroscopy and biolayer interferometry, kineticstudies with IFIT1 and IFIT5 complexes with differently mRNAs wereperformed.