Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
mgr Marta Narczyk (IFD UW)
Starzenie się fosforylazy nukleozydów purynowych z E. coli nie jest prostym przejściem
Ageing of purine nucleoside phosphorylase from E. coli is not a simple transition
W enzymologii, zasadniczo, obowiązuje paradygmat, że przejście białko aktywne ↔ białko nieaktywne jest procesem zero-jedynkowym, to znaczy, że białko istnieje w jednym z tych dwóch stanów. W trakcie badań katalitycznych i wiązania ligandów przez fosforylazę nukleozydów purynowych z E.coli (ecPNP), uzyskiwane wyniki nie dawały się wyjaśnić w ramach tego paradygmatu. Wobec tego przeprowadzono badania starzenia się białka. Okazało się, że jest to proces wieloetapowy. Przy pomocy badań w roztworze udało się zidentyfikować niektóre stany przejściowe i powiązać je ze strukturami krystalograficznymi.
In enzymology, in principle, the paradigm applies, that a transition active protein ↔ inactive protein is a zero-one proces. It means that the protein exists in one of these two states. During the catalytic and ligand binding studies of purine nucleoside phosphorylase from E. coli (ecPNP), the results obtained could not be explained within this paradigm. Therefore, studies on the protein aging were carried out. It turned out that this is a multi-stage process. By conducting the research in solution, we managed to identify some transition states and link them to the crystallographic structures.