Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
2022-01-14 (14:15) 
mgr Tomasz Śpiewla (Szkoła Doktorska Nauk Ścisłych i Przyrodniczych - Nauki Fizyczne, UW)
Ocena interakcji białka IFIT1 z analogami kapów RNA oraz kapowanymi RNA z wykorzystaniem metody termoforezy mikroskalowej (MST)
Celem projektu było zbadanie oddziaływania immunologicznego białka ludzkiego IFIT1 z różnymi ligandami, w tym: syntetycznymi analogami kapów RNA oraz kapowanymi molekułami RNA. Aby tego dokonać, przeprowadziliśmy proces ekspresji i oczyszczania białka IFIT1 w prokaryotycznym systemie ekspresyjnym oraz wykorzystaliśmy techniki chromatografii FPLC, tj. chromatografię affinitywną, jonowymienną oraz filtrację żelową. Powinowactwo białka IFIT1 do ligandów wyznaczaliśmy na podstawie pomiarów stałych dysocjacji (KD) z wykorzystaniem metody termoforezy mikroskalowej (MST). Uzyskane dane potwierdziły oczekiwane prawidłowości dla znanych i dobrze zbadanych struktur kapów RNA, jak i dostarczyły nowych informacji dotyczących interakcji syntetycznych analogów kapów RNA z białkiem IFIT1 w porównaniu z kanonicznymi strukturami, a także ukazało wpływ molekuły RNA na przebieg oraz siłę samego oddziaływania.