Seminarium Zakładu Biofizyki

Celem projektu była synteza koniugatów analogów trimetylokapu i fluorescencyjnych molekularnych rotorów oraz zbadanie i ocena potencjalnego wykorzystania jako nowych narzędzi molekularnych dla snurportyny. Trimetylokap (TMG kap) obecny jest na 5′ końcu łańcucha niektórych małych jądrowych RNA i bierze udział w szeregu procesów biochemicznych związanych m.in. z transportem i dojrzewaniem pre-mRNA. Jest on rozpoznawany przez snurportynę, które w kompleksie z importyną beta transportuje snRNA zakończone trimetylokapem do jądra komórkowego.Coraz częściej rozważa się wykorzystanie fluorescencyjnie znakowanej struktury kapu do śledzenia procesów biologicznych, w których bierze on udział. W swoim komunikacie zaprezentuje syntezę i właściwości różnorodnie modyfikowanych analogów trimetylokapu znakowanych fluorescencyjnymi molekularnymi rotorami (FMR). W swoich badaniach biologicznych wykorzystałem metodę miareczkowania fluorescencyjnego białka oraz metodę miareczkowania liganda snurportyną. Fluorescencja FMR opiera się na zjawisku wewnątrzcząsteczkowej rotacji jednego z segmentów znacznika wokół wiązania σ, co skutkuje odpowiednio bezpromienistym (OFF) lub promienistym (ON) procesem relaksacji. Zastosowanie FMR opiera się na „włączeniu” fluorescencji w wyniku oddziaływania ligand-białko.