Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
2022-01-21 (14:15) 
Jagoda Kuśnierz (Zastosowania Fizyki w Biologii i Medycynie, WF UW)
Poszukiwanie białek homologicznych z PETazą z wykorzystaniem metod opartych o deskryptory lokalnej struktury
Zaśmiecanie naturalnego środowiska wszelkiego rodzaju plastikami jest jednym z największych problemów współczesnej cywilizacji. W związku z tym znalezienie i/lub zaprojektowanie enzymów będących w stanie degradować plastiki, jest jednym z wyzwań dla nowoczesnych technologii. Głównym celem projektu było znalezienie białek homologicznych z PETazą, enzymu pochodzącego z bakterii Ideonella Sakaiensis - zdolnej do powolnego metabolizmu poli(tereftalan etylenu), tworzywa sztucznego powszechnie znanego jako PET. W poszukiwaniu homologicznych białek wykorzystano rozwijaną w Zakładzie Biofizyki FUW metodę deskryptorów lokalnej struktury. Przeskanowane zostały wszystkie białka w Protein Data Bank. Uzyskane wyniki pokrywają się z danymi literaturowymi, i potwierdzają skuteczność zastosowanej metody. Najlepszy wynik, poza mutantami PETazy, uzyskała struktura 4WFK - kutinaza pochodzenia bakteryjnego