Seminarium Zakładu Biofizyki

Celem projektu była analiza wyników sekwencjonowania Schizosaccharomyces pombe. Jest to gatunek grzybów należący do rodziny Schizosaccharomycetaceae. Organizm ten jest to jednokomórkowy eukariota i używany jest jako jeden z organizmów modelowych w biologii molekularnej. Sekwencjonowanie zostało wykonane metodami mRNA-seq oraz ChIP-seq. Zadanie dotyczyło wykonania wstępnej obróbki plików do analizy, rozpoznanie która z metod była używana dla konkretnego zestawu danych, a następnie scharakteryzowanie obszarów genomowych, z którymi białko wiążę się preferencyjnie. Prezentacja zawiera krótki opis używanych narzędzi bioinformatycznych oraz wyniki analizy.