Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
Mateusz Fido, ZFBM Wydział Fizyki UW (IFD UW)
Sposoby obrazowania procesów biologicznych przy pomocy "warzywnych" aptamerów RNA
Aptamery RNA to krótkie oligonukleotydy zaprojektowane do specyficznego wiązania danej cząsteczki. Powstają najczęściej wskutek kierowanej ewolucji in vitro, ale występują też naturalnie w ryboprzełącznikach. Ostatnio na popularności zyskują aptamery zdolne do wiązania cząsteczek fluorescencyjnych, jak np. analogi fluorofora GFP. Takie kompleksy RNA-ligand wykorzystuje się następnie do obrazowania struktur i procesów komórkowych. Ze względu na barwę światła, które emitują, noszą nazwę "warzywnych": istnieją aptamery "Szpinak", "Brokuł", "Mango", itp. Podczas swojej prezentacji opowiem o zastosowaniu takich aptamerów do obrazowania rybosomalnego RNA oraz jak wykorzystałem je do wizualizacji procesu degradacji kapu 5' mRNA.