Seminarium Zakładu Biofizyki

luorowania białek w wątrobie i mózgu szczurów po podaniu leku zawierającego fluor - cynakalcetu. Białka fluorowane identyfikowano przy użyciu podejścia proteomiki „label-free" typu shotgun; rozdział chromatograficzny i analiza metodą spektrometrii mas o wysokiej rozdzielczości; identyfikacja peptydów/białek przy użyciu algorytmu wyszukiwania Mascot; ręczna weryfikacja doświadczalnie wygenerowanego widma MS/MS z teoretycznym widmem MS/MS zidentyfikowanych peptydów fluorowanych. Do analizy zmian w ekspresji białek zastosowano podejście proteomiki ilościowej: wykorzystano program MaxQuant w celu identyfikacji i oznaczenia białek. Wprowadzenie fluoru do organizmu poprzez podawanie leków fluorowanych powodowało tkankowo-specyficzną fluoryzację białek. Na podstawie powyższych badań powstała niniejsza publikacja: https://doi.org/10.3390/ijms23084202. Na seminarium opowiem o całym procesie badawczym od planowania eksperymentu przez pomiar aż do analizy statystycznej i prezentacji końcowych wyników.