Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
Mateusz Lenart (Zastosowania Fizyki w Biologii i Medycynie, Projektowanie Molekularne i Bioinformatyka, Wydział Fizyki UW)
Modelowanie struktur 3D RNA na podstawie targetów CASP
CASP (Critical Assessment of Structure Prediction) to ogólnospołeczny eksperyment mający na celu określenie i postęp w dziedzinie modelowania struktury białka na podstawie sekwencji aminokwasowej. Co dwa lata uczestnicy są proszeni o przesyłanie modeli dla zestawu białek, dla których struktury eksperymentalne nie są jeszcze upublicznione. W tym roku pierwszy raz poza modelami dla zestawu białek należy znaleźć również struktury dla sekwencji RNA.Zaprezentuję metody, którymi posługuję się w celu uzyskania predykcji konformacyjnych.