Seminarium Zakładu Biofizyki

Metaloproteinaza macierzy zewnątrzkomórkowej 9 (MMP-9) jest jednym najintensywniej badanych białek o właściwościach proteolitycznych. Ze względu na swoją specyficzność substratową pełni ważną rolę w licznych procesach fizjologicznych, wśród których można wskazać angiogenezę, plastyczność synaptyczną oraz regulację procesów zapalnych. Nadmierna aktywność MMP-9 powiązana jest m.in. z uszkodzeniem neuronów, przerywaniem bariery krew-mózg, progresją nowotworów oraz chorobami autoimmunologicznymi. Aktywność MMP-9 kontrolowana jest na wielu poziomach, jednak po wydzieleniu z komórki najbardziej istotne stają się aktywacja proteolityczna i inhibicja przez rodzinę białek zwaną tkankowymi inhibitorami metaloproteinaz (TIMP). W czasie wykładu zaprezentowane zostaną wyniki modelowania trzech form MMP-9 – monomeru, homotrimeru oraz dimeru z białkiem NGAL. Opracowane modele zostaną omówione także w kontekście oddziaływania z TIMP-1 – głównym inhibitorem MMP-9.