Seminarium Zakładu Biofizyki
sala B2.38, ul. Pasteura 5
2024-03-22 (14:15) 
(IFD UW)
Synteza pochodnych adenozyny modyfikowanych pierścieniem hydantoiny i ich wprowadzanie w modelowe fragmenty tRNA
Modyfikowane nukleozydy są ważnymi elementami struktury tRNA, o kluczowym znaczeniu w procesie dekodowania informacji genetycznej i komórkowej biosyntezy białek. Obecnie znanych jest ponad 100 różnych modyfikacji tRNA. Niezwykle ciekawym doniesieniem w obszarze chemii kwasów nukleinowych była identyfikacja nowych interesujących modyfikowanych nukleozydów: cyklicznej N6-treonylokarbamoiloadenozyny (ct6A) oraz cyklicznej 2-metylotio-N6-treonylokarbamoiloadenozyny (ms2ct6A), które występują w pętlach antykodonowych tRNA w pozycji 37. a ich funkcja biologiczna nie jest dotychczas poznana. Obecnie wiadomo, że cykliczne modyfikacje ct6A i ms2ct6A są wynikiem wewnątrzkomórkowej dehydratacji liniowych nukleozydów: t6A i ms2t6A, znanych i badanych od ponad 50 lat, występujących powszechnie w 37. pozycji tRNA wszystkich organizmów. Charakterystyczną cechą struktury ct6A/ms2ct6A jest skręcone ułożenie pierścienia hydantoiny względem reszty adeniny, kontrastująco różne od planarnego ułożenia reszty treoniny w strukturze t6A/ms2t6A. Dotychczas właśnie takie planarne ułożenie uważane było za element decydujący o biologicznej funkcji t6A/ms2t6A. Wszechstronne badania biochemiczne i strukturalne nad poznaniem roli biologicznej ct6A/ms2ct6A niosących motyw hydantoiny jako nowej modyfikacji tRNA wymagają dostępu do syntetycznych nukleozydów ct6A/ms2ct6A oraz modelowych oligonukleotydów (17-mery RNA) o sekwencji ramion antykodonów tRNA zawierających te modyfikacje.
Dr inż. Katarzyna Frankowska jest absolwentką Wydziału Chemicznego Politechniki Łódzkiej. Pracę inżynierską oraz magisterską zrealizowała w Instytucie Chemii Organicznej, w Zespole Komponentów Kwasów Nukleinowych pod kierunkiem prof. Elżbiety Sochackiej. Studia doktoranckie ukończyła w 2023 r. na Wydziale Chemicznym Politechniki Łódzkiej, podczas których kontynuowała badania z zakresu chemii kwasów nukleinowych pod kierunkiem prof. dr hab. inż. Elżbiety Sochackiej.
Dr inż. Katarzyna Frankowska była stypendystą grantu OPUS 13 przyznanego przez Narodowe Centrum Nauki oraz kierownikiem czterech projektów: trzech finansowanych z Funduszu Młodych Naukowców na Wydziale Chemicznym PŁ oraz jednego z Własnego Funduszu Stypendialnego Politechniki Łódzkiej.W latach 2021 – 2023 pracowała jako asystent/adiunkt w grupie pracowników naukowo-dydaktycznych w Instytucie Chemii Organicznej Politechniki Łódzkiej.W 2023 roku rozpoczęła staż podoktorski w Zespole prof. Jacka Jemielitego oraz dr inż. Joanny Kowalskiej, włączając się w realizację projektu pt. „Horyzont doskonałości w zastosowaniach matrycowego RNA w immunoOnkologii [HERO]” finansowanego w ramach Wirtualnego Instytutu Badawczego (WIB) ze środków Funduszu Polskiej Nauki.
Dr inż. Katarzyna Frankowska jest absolwentką Wydziału Chemicznego Politechniki Łódzkiej. Pracę inżynierską oraz magisterską zrealizowała w Instytucie Chemii Organicznej, w Zespole Komponentów Kwasów Nukleinowych pod kierunkiem prof. Elżbiety Sochackiej. Studia doktoranckie ukończyła w 2023 r. na Wydziale Chemicznym Politechniki Łódzkiej, podczas których kontynuowała badania z zakresu chemii kwasów nukleinowych pod kierunkiem prof. dr hab. inż. Elżbiety Sochackiej.
Dr inż. Katarzyna Frankowska była stypendystą grantu OPUS 13 przyznanego przez Narodowe Centrum Nauki oraz kierownikiem czterech projektów: trzech finansowanych z Funduszu Młodych Naukowców na Wydziale Chemicznym PŁ oraz jednego z Własnego Funduszu Stypendialnego Politechniki Łódzkiej.W latach 2021 – 2023 pracowała jako asystent/adiunkt w grupie pracowników naukowo-dydaktycznych w Instytucie Chemii Organicznej Politechniki Łódzkiej.W 2023 roku rozpoczęła staż podoktorski w Zespole prof. Jacka Jemielitego oraz dr inż. Joanny Kowalskiej, włączając się w realizację projektu pt. „Horyzont doskonałości w zastosowaniach matrycowego RNA w immunoOnkologii [HERO]” finansowanego w ramach Wirtualnego Instytutu Badawczego (WIB) ze środków Funduszu Polskiej Nauki.